研究院实行院长负责制，下设“两会”、“三室”、“四部”、“五中心”。即，研究院机构设置以国家、地方需求为导向，按照“高效、灵活、有序”的原则，设立理事会、学术委员会；办公室、资料室和编辑室；科研交流部、教学培训部、项目信息部和人事财务部；社会管理创新研究中心、区域经济与社会发展研究中心、资源环境研究中心、城市经济与社区管理研究中心、社会保障与社会组织研究中心。

　　研究院聘请原湖北省人民政府副省长、人大常委会副主任蒋大国教授、博导为院长；聘请著名经济学家、中国人民大学原校长纪宝成教授和著名社会学家、中国社会学会名誉会长郑杭生教授为名誉院长；聘请张绍焱教授为常务副院长、夏玉珍教授为副院长、刘圣欢教授为院长助理。